Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
6030445D17RikE9Q8F9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
6030445D17RikE9Q8F9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms