Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm20425E9Q035 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20425E9Q035 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20425E9Q035 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms