Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm4491E0CX42 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm4491E0CX42 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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