Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cited4Q9WUL8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cited4Q9WUL8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms