Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Txnrd1Q9JMH6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Txnrd1Q9JMH6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Txnrd1Q9JMH6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Txnrd1Q9JMH6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd1Q9JMH6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Txnrd1Q9JMH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184 ms