Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ms4a4bQ9ES61 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4bQ9ES61 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms