Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Irx6Q9ER75 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Irx6Q9ER75 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms