Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Swt1Q9DBQ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Swt1Q9DBQ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Swt1Q9DBQ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms