Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim23Q9DAL0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smim23Q9DAL0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms