Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4933402E13RikQ9D4D2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4933402E13RikQ9D4D2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933402E13RikQ9D4D2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms