Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rsl24d1Q99L28 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rsl24d1Q99L28 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms