Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup62Q63850 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup62Q63850 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms