Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a1Q60714 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a1Q60714 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a1Q60714 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms