Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930567H17RikQ3V0K5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930567H17RikQ3V0K5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms