Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bop1P97452 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bop1P97452 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms