Protein–RNA interactions for Protein: P16675

Ctsa, Lysosomal protective protein, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsaP16675 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsaP16675 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsaP16675 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsaP16675 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms