Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmb10O35955 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psmb10O35955 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms