Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Plod3Q9R0E1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Plod3Q9R0E1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms