Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smco4Q9JIS3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smco4Q9JIS3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms