Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irx6Q9ER75 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Irx6Q9ER75 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms