Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox9Q9EQM5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rhox9Q9EQM5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox9Q9EQM5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox9Q9EQM5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox9Q9EQM5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox9Q9EQM5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox9Q9EQM5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox9Q9EQM5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rhox9Q9EQM5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms