Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SgshQ9EQ08 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SgshQ9EQ08 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SgshQ9EQ08 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms