Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SrpraQ9DBG7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrpraQ9DBG7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms