Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ggnbp1Q6K1E7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ggnbp1Q6K1E7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms