Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BB287469Q3UT53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BB287469Q3UT53 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms