Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cmklr1P97468 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cmklr1P97468 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cmklr1P97468 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms