Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mfsd4b4J3QNS5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mfsd4b4J3QNS5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 203.3 ms