Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp42B2RQC2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp42B2RQC2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp42B2RQC2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms