Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cited4Q9WUL8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cited4Q9WUL8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cited4Q9WUL8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms