Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hmgn5Q9JL35 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hmgn5Q9JL35 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hmgn5Q9JL35 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms