Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LratQ9JI60 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LratQ9JI60 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LratQ9JI60 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms