Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcl3Q8BVF2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcl3Q8BVF2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms