Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Smchd1Q6P5D8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smchd1Q6P5D8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smchd1Q6P5D8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms