Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rftn1Q6A0D4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rftn1Q6A0D4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rftn1Q6A0D4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms