Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Trappc1Q5NCF2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trappc1Q5NCF2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms