Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SfswapQ3USH5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SfswapQ3USH5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SfswapQ3USH5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms