Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lmod2Q3UHZ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lmod2Q3UHZ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lmod2Q3UHZ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms