Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Taf1bP97358 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Taf1bP97358 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Taf1bP97358 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Taf1bP97358 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Taf1bP97358 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Taf1bP97358 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Taf1bP97358 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Taf1bP97358 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Taf1bP97358 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Taf1bP97358 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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