Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux2P70298 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cux2P70298 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Cux2P70298 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux2P70298 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux2P70298 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux2P70298 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cux2P70298 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux2P70298 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux2P70298 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cux2P70298 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Cux2P70298 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cux2P70298 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms