Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kdm5cP41230 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kdm5cP41230 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kdm5cP41230 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Kdm5cP41230 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms