Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TfamP40630 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TfamP40630 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TfamP40630 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TfamP40630 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TfamP40630 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TfamP40630 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TfamP40630 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TfamP40630 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TfamP40630 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TfamP40630 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TfamP40630 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TfamP40630 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TfamP40630 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TfamP40630 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TfamP40630 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TfamP40630 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TfamP40630 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TfamP40630 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms