Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnga1P29974 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cnga1P29974 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga1P29974 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms