Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Psmb9P28076 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb9P28076 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms