Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spi1P17433 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms