Protein–RNA interactions for Protein: P0C028

Nudt11, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-beta, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt11P0C028 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nudt11P0C028 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms