Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lamc1P02468 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lamc1P02468 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lamc1P02468 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lamc1P02468 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms