Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dll3O88516 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Dll3O88516 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dll3O88516 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dll3O88516 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Dll3O88516 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dll3O88516 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dll3O88516 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms