Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpd52l1O54818 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tpd52l1O54818 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52l1O54818 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms