Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb10O35955 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb10O35955 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228 ms