Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edf1Q9JMG1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edf1Q9JMG1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms